大家都知道水稻是什么，但很少知道菰（讀作gū）為何物？其實(shí)，菰是我國(guó)早期主要谷類(lèi)作物之一，它的種子叫菰米或雕胡米，為“六谷”之一，在我國(guó)古代詩(shī)詞中有大量描述，贊美其香美可口；但其后來(lái)被水稻取代，目前栽培種已消失。同時(shí)，菰會(huì)受到黑粉真菌侵染，形成長(zhǎng)期共生關(guān)系；受侵染的菰可以形成可食用的鮮嫩膨大莖，被我們祖先馴化成蔬菜作物——茭白。該菌-寄主共生關(guān)系，為研究宿主在病原體長(zhǎng)期侵染下基因組的適應(yīng)性分化提供了一個(gè)難得的遺傳材料。
近日，由中國(guó)水稻研究所郭龍彪研究員和浙江大學(xué)樊龍江教授等團(tuán)隊(duì)開(kāi)展合作研究，通過(guò)野生菰和茭白基因組測(cè)序以及轉(zhuǎn)錄組分析，共預(yù)測(cè)到43000多個(gè)菰基因，其中包含大量核苷酸結(jié)合位點(diǎn)（NBS）類(lèi)抗性基因；發(fā)現(xiàn)其與水稻有高度基因組共線性，共鑒定出共線性模塊1498個(gè)，涵蓋50.9%菰基因組基因。通過(guò)比較基因組分析，揭示了宿主茭白基因組抗性免疫受體因子相關(guān)基因大量缺失和抑制是有益菌-寄主長(zhǎng)期共生的關(guān)鍵。相關(guān)研究成果于2015年6月在線發(fā)表在國(guó)際知名刊物《植物雜志（Plant Journal）》上。
真菌-植物互作共生分子機(jī)理的解析，對(duì)創(chuàng)新型農(nóng)業(yè)育種利用與植物保護(hù)具有重要的理論意義和應(yīng)用價(jià)值。（通訊員 章蓉蓉）
論文連接:
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.12912/abstract
