近日，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所農(nóng)業(yè)宏基因組學(xué)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)構(gòu)建了六倍體菊芋染色體級(jí)別參考基因組，解析了菊芋基因組起源和演化過(guò)程，為向日葵屬作物的起源進(jìn)化研究、抗逆基因挖掘、育種改良和工業(yè)化利用提供了寶貴的資源。相關(guān)研究成果發(fā)表在《植物通訊（Plant Communications）》上。
菊芋俗稱洋姜，兼具生態(tài)防護(hù)和經(jīng)濟(jì)利用雙重價(jià)值，然而菊芋基因組極其復(fù)雜，基因組的測(cè)序組裝面臨重復(fù)序列比例高、雜合度高、染色體數(shù)多等挑戰(zhàn)，其六倍體基因組至今仍未破譯。
研究人員利用測(cè)序等技術(shù)，完成了六倍體菊芋的高質(zhì)量染色體級(jí)別組裝，基因組組裝大小為10.5 Gb，共含有199842個(gè)蛋白編碼基因。研究首次發(fā)現(xiàn)，菊芋約2百萬(wàn)年前發(fā)生了全基因組三倍化事件，是菊芋形成六倍體的主要原因。
該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、深圳市基礎(chǔ)研究項(xiàng)目、深圳市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室基金和農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新計(jì)劃的支持。（通訊員 馬昕怡）
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https://doi.org/10.1016/j.xplc.2023.100767
