近日，中國農(nóng)業(yè)科學院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所發(fā)布了兩個高質(zhì)量的檀香染色體水平基因組，揭示了檀香基因組的進化歷史，為檀香新品種的開發(fā)、改良和保護奠定了基礎。相關(guān)研究成果發(fā)表在《通訊生物（Communications Biology）》上。
檀香被稱之為“黃金之樹”，以其持久和獨特的香氣而聞名，有很高的經(jīng)濟價值，然而，除印度檀香外，檀香目其他品種均未報道過染色體級的基因組，為了更好地研究、利用和保護檀香屬的寶貴資源，研究團隊利用HiFi測序和Hic組裝技術(shù)，成功獲得了兩個檀香高質(zhì)量全基因組組裝序列，通過進化基因組分析，描述了檀香基因組進化歷史，發(fā)現(xiàn)檀香近期發(fā)生過一次全基因組復制事件，且為檀香科分支獨有，說明了檀香科物種在與蒜頭果分化后發(fā)生了適應性進化。研究人員通過比較基因組學分析，發(fā)現(xiàn)檀香基因組中轉(zhuǎn)座子含量與檀香目另一物種蒜頭果基因組中轉(zhuǎn)座子含量相差巨大，導致前者的基因組的大小僅為后者的六分之一。
該研究得到國家自然科學基金、中國農(nóng)業(yè)科學院“青年英才計劃”等項目支持。（通訊員 馬昕怡）
原文鏈接：https://www.nature.com/articles/s42003-023-04980-2
檀香基因組（左）和斐濟檀香基因組（右）
