記者從中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所獲悉，該所油料作物基因組學(xué)與抗病性改良創(chuàng)新團隊前不久破譯了油菜基因組的全轉(zhuǎn)錄信息密碼，構(gòu)建了油菜十萬余個基因的轉(zhuǎn)錄全景圖，至此油菜基因功能研究第一次有了標準的可參考的基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫。該研究成果已于近日在線發(fā)表于學(xué)術(shù)期刊《植物學(xué)報》。
?。▓D為油菜功能基因轉(zhuǎn)錄信息實例圖，中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所供圖）
據(jù)團隊首席科學(xué)家、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院油料作物研究所研究員劉勝毅介紹，隨著科技的發(fā)展，人類對各種作物的了解越來越深入。其中，基因庫的建立對農(nóng)業(yè)科技的發(fā)展至關(guān)重要。此前，水稻、玉米、小麥等主要作物，都已經(jīng)建立了基因庫。如今，油菜也有了基因庫。
劉勝毅說，油菜基因組包含約12億個堿基和十余萬個基因，如何解讀這些海量的基因組信息，成為功能基因研究的重要任務(wù)?；蚴峭ㄟ^轉(zhuǎn)錄形成mRNA再翻譯成蛋白質(zhì)。由于基因的轉(zhuǎn)錄通常存在多種可變的剪切方式，從而一個基因可以形成許多種不同的mRNA。
此前，由于技術(shù)和資源的限制，油菜一直缺乏全基因組水平所有基因的轉(zhuǎn)錄mRNA數(shù)據(jù)庫，導(dǎo)致油菜基因功能研究缺乏可查詢和可參考的基因注釋信息。為了突破這一瓶頸，劉勝毅團隊采用最新的三代測序技術(shù)，準確測定了油菜全長轉(zhuǎn)錄組，并自主開發(fā)了一套用于多倍體油菜復(fù)雜基因組的分型方法，繪制了油菜基因組的轉(zhuǎn)錄全景圖，構(gòu)建了油菜“標準”的參考轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)庫。
來自中國農(nóng)科院的消息稱，該研究成果更新了人們對油菜基因和基因組的認識和理解，將為甘藍型油菜功能基因和遺傳改良研究、以及基因組設(shè)計育種提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)和理論指導(dǎo)，有力支撐油菜功能基因的相關(guān)研究工作。
