近日，中國農(nóng)業(yè)科學院鄭州果樹研究所草莓種質(zhì)改良團隊聯(lián)合中國農(nóng)科院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所聯(lián)合發(fā)布八倍體栽培品種紅顏草莓的端粒到端粒完整基因組，系統(tǒng)解析了八倍體草莓亞基因組結(jié)構(gòu)和遺傳分化，并解析了亞基因組的表觀遺傳進化機制。相關(guān)成果發(fā)表于《園藝研究》（Horticulture Research ）。
紅顏草莓。中國農(nóng)科院供圖
紅顏草莓是我國生產(chǎn)主栽品種，其品質(zhì)優(yōu)良、豐產(chǎn)性強、商品性好，但對炭疽病、白粉病等抗性差，嚴重制約草莓產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展。
該研究以紅顏草莓為材料，從頭組裝了八倍體草莓端粒到端?；蚪M，鑒定出包含ABCD四個亞基因組共109320個基因。數(shù)據(jù)分析表明，A亞基因組的結(jié)構(gòu)變異最少，編碼基因最多，重復(fù)序列最少，經(jīng)歷更強的凈化選擇，成為優(yōu)勢亞基因組。通過構(gòu)建草莓屬植物系統(tǒng)進化樹，他們發(fā)現(xiàn)B亞基因組與飯沼草莓（F. iinumae）聚為一支，且與C、D亞基因組來源于同一祖先。
紅顏草莓端粒到端粒基因組成功組裝注釋和全基因組甲基化分析為后續(xù)開展基因功能挖掘以及品質(zhì)和抗性分子育種提供了理論和數(shù)據(jù)支撐。
中國農(nóng)業(yè)科學院鄭州果樹研究所助理研究員宋艷紅和深圳農(nóng)業(yè)基因組所博士后彭艷玲為論文共同第一作者，鄭州果樹研究所研究員周厚成和深圳農(nóng)業(yè)基因組所研究員周永鋒為共同通訊作者。
該研究得到了國家重點研發(fā)、河南省重大科技專項、河南省大宗水果產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系和中國農(nóng)業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程項目的資助。
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1093/hr/uhad252
