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    本報訊 近日，中國農(nóng)業(yè)科學院油料作物研究所芝麻與特色油料遺傳育種創(chuàng)新團隊在國際知名學術(shù)刊物《核酸研究》（Nucleic Acids Research）上發(fā)布了植物微衛(wèi)星DNA及其標記開發(fā)數(shù)據(jù)庫PMDBase。該數(shù)據(jù)庫的創(chuàng)建和共享將為全球作物功能基因組學和分子育種研究提供全面而便利的基礎(chǔ)平臺。

    微衛(wèi)星DNA，也稱為SSR，是涉及許多重要生物功能的基因組成分，已被廣泛地應(yīng)用于作物基礎(chǔ)研究，包括遺傳多樣性、連鎖和關(guān)聯(lián)作圖、標記輔助選擇、品種鑒定和進化分析等。

    據(jù)介紹，該團隊開發(fā)了一套便捷高效的微衛(wèi)星DNA位點鑒定及分子標記開發(fā)流程，對截至目前已完成基因組測序的110個植物進行了鑒定，共發(fā)掘微衛(wèi)星DNA位點26,230,099個，并為每個位點開發(fā)了3對引物。用戶可獲取目標物種有用的微衛(wèi)星DNA位點和引物信息，以及每個位點所屬物種、位置、起止、類型、大小以及序列信息。用戶可以利用數(shù)據(jù)庫進行微衛(wèi)星DNA位點在線鑒定及分子標記在線設(shè)計。該數(shù)據(jù)庫還提供了多種檢索方式和下載功能，所有數(shù)據(jù)和分析結(jié)果都可下載。

    該數(shù)據(jù)庫為全球研究者們提供了在線的、友好的、便利的植物微衛(wèi)星DNA鑒定平臺，是目前國際上涵蓋最多植物物種和信息最全面的綜合性數(shù)據(jù)庫，填補了同領(lǐng)域相關(guān)研究空白。