近日，中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所農(nóng)業(yè)基因組學(xué)技術(shù)研發(fā)與應(yīng)用創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)發(fā)布了首個(gè)榕屬植物對(duì)葉榕端粒到端粒完整基因組，修正了原有基因組中存在的大量的間隙和組裝錯(cuò)誤，大幅提升了對(duì)葉榕基因組的連續(xù)性、完整性和準(zhǔn)確性。相關(guān)研究成果發(fā)表在《園藝研究（Horticulture research）》上。
榕樹(shù)是桑科榕屬800多種植物的統(tǒng)稱，廣泛分布于熱帶和亞熱帶地區(qū)，榕屬植物包含6個(gè)亞屬，其中對(duì)葉榕屬于聚果榕亞屬，是典型的功能雌雄異株植物，解析對(duì)葉榕基因組對(duì)生物學(xué)性狀解析和基因功能的研究至關(guān)重要，然而，原有基因組中存在大量的信息缺失和組裝錯(cuò)誤，阻礙了進(jìn)一步研究。
因此，科研團(tuán)隊(duì)綜合利用多種測(cè)序技術(shù)，在原有基因組基礎(chǔ)上重新組裝、完善，發(fā)布了首個(gè)榕屬植物對(duì)葉榕端粒到端粒完整基因組，該基因組大小371.8兆，所有序列均掛載到14條染色體上，成功注釋了26642個(gè)編碼蛋白基因，經(jīng)評(píng)估，基因組完整度達(dá)98.7%，并且基因組的連續(xù)性和準(zhǔn)確性均得到了大幅提升。在此基礎(chǔ)上，研究進(jìn)一步構(gòu)建了雄性和雌性花不同發(fā)育時(shí)期的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，并鑒定得到了雄花發(fā)育的關(guān)鍵基因，為研究榕屬植物重要特征和性別決定提供了重要資源。
該研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的支持。（通訊員 馬昕怡）
原文鏈接：https://doi.org/10.1093/hr/uhad257
