近日,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究所棉花生物技術(shù)設(shè)計(jì)育種創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一種用于驗(yàn)證蛋白與DNA互作的SRS(SGR1-based reporter system)系統(tǒng),該系統(tǒng)具有高效、可靠、智能化、可視化功能。相關(guān)研究成果發(fā)表在《植物生物技術(shù)雜志(Plant Biotechnology Journal)》上。
近年來(lái),RNA-Seq、ChIP-Seq等組學(xué)技術(shù)推動(dòng)了轉(zhuǎn)錄因子下游基因的規(guī)?;l(fā)現(xiàn),但在植物體內(nèi)快速且準(zhǔn)確地驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄因子直接結(jié)合的下游靶基因依然具有挑戰(zhàn)性。
該研究通過(guò)使用葉綠素降解基因,開(kāi)發(fā)了一個(gè)能夠通過(guò)觀察植物葉片顏色變化進(jìn)行可視化報(bào)告的系統(tǒng),并配套開(kāi)發(fā)追蹤顏色變化的智能模型SMGY。目前,團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)的SRS系統(tǒng)已在水稻、棉花、辣椒等多種作物中成功驗(yàn)證了5組不同類型的轉(zhuǎn)錄因子與DNA的互作,并證明該系統(tǒng)同樣適用于非煙草物種,如油菜和生菜等。SRS系統(tǒng)的開(kāi)發(fā)為構(gòu)建基因遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及作物智能設(shè)計(jì)育種提供了一種新的技術(shù)方法。
該研究得到了科技創(chuàng)新2030重大項(xiàng)目、國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金、中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技創(chuàng)新工程等項(xiàng)目資助。(通訊員:崔艷)
原文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pbi.14488