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農業(yè)農村部沼氣科學研究所于1979年經(jīng)國務院批準成立，是中國唯一專業(yè)從事沼氣科學研究的國家級科研機構。

全所在職職工180余人，其中，正高級職稱19人、副高級職稱32人。研究所有在讀研究生50余人，在站博士后4人，有全國農業(yè)科研杰出人才2人，四川省學術與技術帶頭人2人，四川省“天府青城計劃”創(chuàng)新領軍人才1人、天府科技菁英2人，中國農業(yè)科學院“農科英才”各類人選6人。

研究所擁有聯(lián)合國糧農組織（FAO）沼氣技術研究培訓參考中心、科技部沼氣技術國際科技合作基地、農業(yè)農村部農村可再生能源開發(fā)利用重點實驗室等平臺20個。建有世界先進、國內規(guī)模最大的厭氧微生物菌種資源保藏庫—中國厭氧微生物菌種保藏管理中心（CCAM）。

主要職能是厭氧微生物資源收集、整理、保存、評價等長期性基礎性研究；農業(yè)農村三大污染源共性關鍵技術研究；農村生物質能與人居環(huán)境配套宏觀戰(zhàn)略及政策理論研究；農村沼氣與生物天然氣國家（行業(yè)）標準制修訂；規(guī)劃編制、技術推廣與示范應用；國際、國內技術培訓與國際合作。

建所以來，先后承擔國家863、973、重大專項、科技支撐和國家自然科學基金等科研項目100余項，取得專利授權300余項，發(fā)表科研論文800余篇，制修訂國家和行業(yè)標準56項，獲得國家科技進步二等獎2項、三等獎2項，四川省和農業(yè)部科技進步一等獎4項、二等獎6項。